De waterschappen in Nederland, ook wel Hoogheemraadschappen genoemd, zijn verantwoordelijk voor de dijken, peilbeheer, kwaliteit van het oppervlaktewater en (soms) het beheer van de vaarwegen. Het CDA is binnen ieder waterschap (in totaal 26) vertegenwoordigd met een eigen fractie. In de meeste gevallen levert het CDA ook een vertegenwoordiger aan het dagelijks bestuur (hoogheemraad genaamd) van het waterschap.